真正的卫生安全隐患都潜伏在基层，但本市卫生监督人员难以监测到所有的基层单位。本市从今年起实施卫生监督协管员制度，随时发现举报诸如非法行医等卫生监督线索。每个社区卫生服务中心（乡镇卫生医院），卫监协管员的数量原则上不低于5人，每个社区卫生服务站、村卫生室聘任一名兼职卫监协管员。
目前，北京市卫生监督专业队伍不足2000人，但监管着12万所企事业单位和工商组织，力量远远不够。覆盖面和覆盖频次并不能令人满意，尤其是在山区、边缘地带。
“在基层，我们连‘眼线’都没有，很多问题都是媒体曝光后才知道，这一点我们要好好想想如何解决。”在日前举行的全市卫生监督工作会上，市卫生局副局长雷海潮表示，市卫生局已经印发《关于做好卫生监督协管服务工作的指导意见》，卫生监督协管服务是卫生部正在大力推进的一项医改重点任务，也是解决目前监督人员不足、基层监督力量薄弱、监督覆盖频次不高的有效手段。
今年上半年16个区县全面推开卫监协管服务，目标是及时发现违法违规线索和隐患，上传卫生监督信息，协助查处违法违规事件和案件，保障广大人民群众卫生安全。
卫生监督协管员从何而来？市卫生局表示，社区卫生服务中心主要负责人、相关科室负责人都应聘为协管员，其他人员可由预防保健人员兼任。截至去年年初，全市已有超过350家社区卫生服务中心和2900多家社区卫生服务站。也就是说，本市将新增4000多名卫生监督协管员。卫监协管员将参加卫生部门的统一培训，考核合格后获岗位证书才能上岗。
卫监协管员并非替代目前的专职卫生监督员，而是卫监的“触角”和“眼线”，增加在基层发现线索和隐患的能力。同时考虑到各区县卫监承担的任务不一样，卫监协管员的具体职责由各区县制定。
此外，为了使监督更加科学，本市今年将探索电子监控大型餐饮连锁企业、大型公共场所等，其中将在线监测餐饮企业食材采购、使用和索证索票等过程。
本市还将试点实施监控大型公共场所空气质量，并公示有关信息，以维护公众健康；在游泳场馆，将试点水质远程在线监控系统。
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